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实验室用Codex+ChatGPT 从基因组挖抗菌候选物

César de la Fuente的实验室,现在有个新动作:靠Codex和ChatGPT,从活生物和已灭绝物种的基因组里,挖掘能对付耐药菌的抗菌候选物。

找抗菌物的新路径

之前研发抗菌分子,大多是从现有生物的样本里一点点筛选,效率低还容易错过冷门资源。这个实验室换了玩法,直接用AI处理基因组数据——覆盖两类之前没被重视的对象:活生物和已灭绝物种。已灭绝物种的基因组样本难获取,数据也零散,过去很少用来找抗菌物,但AI能快速整理这些数据,帮实验室找到可能有用的基因片段。

AI的核心动作

他们没给AI设定复杂的筛选规则,就是让Codex和ChatGPT分析活生物与已灭绝物种的基因组。这两个工具的强项,是处理大量的序列数据,能在短时间里扫完海量的基因信息,找出符合抗菌特性的候选。不用像传统方法那样,每个候选都要单独做实验验证,至少能先缩小范围,减少前期的工作量。

对耐药菌问题的实际指向

耐药菌感染现在是公共卫生领域的棘手问题,很多传统抗生素对它们失效,新抗菌物的研发速度赶不上耐药菌进化的速度。这个实验室的尝试,相当于把AI和基因组数据结合,开辟了一条新的研发路径。虽然目前还只是在筛选阶段,但至少比传统筛法快很多,也能利用之前被忽略的物种资源。用AI挖灭绝物种的抗菌基因,会不会是解决耐药菌的关键突破口?


素材来源:OpenAI News · AI情报、大模型、AI应用落地、科研前沿
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